细胞核内的基因决定细胞结构，主要表现在蛋白质合成，当中必然存在蛋白质种类创新。改变了基因后细胞结构改变，即使外型上不改变，其中实质性的新蛋白质，起码产生两种歧义：一是蛋白质本身的有害性，二是诱化产生的酶的次生有害性。前者有毒的所谓治虫防虫蛋白蛋已存在无疑；后者是因为立体构造的特殊，必然诱导培育新的消化酶，而这种能对付高强蛋白的酶，就可能对体内别的蛋白质产生有害作用。
举个简单例子，酿酒用不同的含淀粉材料，先转化成糖，进一步转化成酒，其中有两类酶，这些酶就是蛋白质之一，可以利用原淀粉材料中的蛋白质生长繁殖。当有创新型可能有害蛋白存在，可能酿酒这条旧公式就不适用了。同理，含创新型蛋白质的主粮，我们人体消化和利用的方式也许会发生改变。
作为主粮的转基因作品，我相信不含有害蛋白质，因为这是能作为主粮的起码条件。但是，这创新蛋白质的后续影响是链锁而来的，我怀疑研究是否通透和彻底。
另外，那种所谓所有物质在体内彻底消化的说法不科学，基因物质被彻底消化成核糖和嘌呤和嘧啶等到进一步被消化或被重新利用是原有认识，当创新的基因片断存在时这个结论或许未得到证实。会不会有基因片断被利用？进而产生人类基因携带有害化部位，未得知。就算机率很低，意外都是意外而来，而且影响很大。
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