1产生抗性杂草
由转基因的种子生长出的农作物会对同一区域的杂草产生影响。提高农作物抗性的重组基因进入杂草体内，几年以后，杂草也会产生抗性。这就需要使用更多的化学剂，而化学剂会影响农作物食用的安全性。化学剂含量过高，食物便不可食用。
2致使植物刺激素含量增多
草甘膦的使用能提高农作物的抗草性，但也导致农作物体内植物雌激素含量的增多。植物雌激素会对包括人类在类的所有哺乳动物产生危害，儿童极易受到高含量植物雌激素的影响，其会产生危险，并带来长期的健康危害。
3产生未知毒素
转基因的种子和食品可能含有未知毒素和在人体内从未发现过的过敏原。1989年生产的左旋色氨酸添加剂就是一个很好的例子。这种添加剂导致了37人的死亡，并对1500多人的健康产生危害。添加剂中的细菌经过了基因重组，使得添加剂中产生了一种新型的有毒氨基酸。
4负作用风险
转基因食品的危险还在于其会带来一种从未出现过的负作用。这种负作用可能存在于两种不同的转基因食品之间，或者存在于食品基因与某些药物之间。由于转基因农作物出现的时间并不长以及新品种不断涌现，这种负作用尚未得到充分的证据证明。
5缺乏长期研究
转基因食品缺乏长期研究，短期信息也很少。政府假定转基因食品的危害与非转基因植物的一样，所以并不反对在食物链中使用转基因食品，真是荒唐至极。植物基因进行重组以后会产生严重的风险与安全隐患，而今尚无长期的风险信息表明这些食物是否存在长期危害。
6转基因食品未被标识
缺乏产品标签是转基因食品的最大危险之一。在美国，转基因食品占食品总供应的四分之一，也许更多。这些食品没有标明是否经过转基因，所以你不知道哪些食物存在较大风险，也就免不了会购买，无法保护家人的健康。
7对人类基因的未知影响
我们还不知道转基因食品是否会对人类基因产生影响，起初，科学家和研究人员认为，消化过程会破坏重组基因，但最近他们在一些幼鼠的大脑中发现了这些重组基因。这对婴幼儿来说，危害极大，并给所有食用者带来未知的风险。
8改变生物体生命特征
用转基因农作物喂养动物，其结果将无可预料。奶牛食用部分转基因大豆以后，牛奶中的脂肪含量会增加。这表明转基因食品会改变生物原本声明特征，故而其安全性不可与传统食品的相提并论。
9产生抗药性
昆虫从长期看来，以减少农药使用为目的的转基因食品反而会导致化学剂使用量的增加，昆虫对常用的农药也会产生抗性。这就带来昆虫危害，影响食物供应，导致食物匮乏。
10转基因食品
已知信息已经被曲解目前人们已掌握的有关转基因食品的信息虽然还非常少，但是这些信息已经被曲解，人们对这些已知信息的理解缺乏准确性。当抗农达转基因大豆获准进入市场时，该产品的信息是基于传统大豆的安全水平及化合物的浓度水平而非其自身的实验数据。
附 人民网：转基因食品引发过敏 揭露转基因食品7大危害
2012年09月09日
近日，美国一科研机构发布了其对24名中国湖南省儿童进行转基因大米人体试验的结果，引起了国际的强烈反对。如今你走在超市里面，都很容易发现转基因食品在售卖，它们逐渐入侵我们的生活。你是否经常吃转基因食品?你知道转基因食品可能对人体产生什么危害吗?
1.营养破坏
转基因食品中的主要营养成分、微量营养素及抗营养因子的变化，会降低食品的营养价值，使其营养结构失衡。科学家们认为外来基因会以一种人们目前还不甚了解的方式破坏食物中的营养成分。
2.或不安全
未进行较长时间的安全性试验：基因化食品改变了我们所食用食品的自然属性，它所使用的生物物质不是人类食品安全提供的部份，未进行长时间的安全试验，没有人知道这类食品是安全的。
3.嗜酸性肌痛
Mayeno,A.N.等(1994)报告，发生一种新的，不明原因的病症，主要表现为嗜酸性肌痛。临床表现有麻痹、神经问题、痛性肿胀、皮肤发痒、心脏出现问题，记忆缺乏、头痛、光敏、消瘦(Brenneman,D.E.等，1993;Love,L.A.等，1993)。后查明系日本一公司生的基因化工程细菌产生的色氨酸所致。食用者在3个月后发病，导致37人死亡，1500人体部份麻痹，5000多人发生偶尔性无力。据测定，含量为0.1%便可杀死人体。
4.胃肠道问题
最令人担心的是插入到转基因大豆里的基因转移到生活在我们肠道的细菌的DNA里面去，并继续发挥作用。这意味着吃Bt玉米所造成的玉米片，会把我们的肠道细菌转变成生活着的农药制造厂，可能直至我们死为止。美国人在过去十年中，有着大幅增加的胃肠道的问题。这种大量增加，医生多认为食用转基因食品造成的。最严重的问题还不止于此。
5.过敏
在转基因操作中，含有从细菌中提取的基因的食品有可能导致过敏现象的扩展，使人发生过敏反应，特别是对儿童，孕妇和具有过敏体质的成人。比如:科学家将玉米的某段基因加入到大豆、小麦和贝类动物的基因中，蛋白质也随基因加了进去，那么，以前吃玉米过敏的人就可能对这些大豆、小麦和贝类食品过敏。
6.心脑血管疾病
这些转基因大豆里，被他们的生物科学家植入了饱和脂肪基因。这些基因导致转基因大豆生产出来的豆油，在进入人体以后，会形成大量的饱和脂肪，增加了血液的血粘稠度，为脂肪肝、高血脂、脑血栓等重大心脑血管疾病埋下了慢性定时炸弹。
7.引发新疾病
转基因技术采用耐抗菌素基因来标识转基因化的农作物，这就意味着农作物带有耐抗菌素的基因。这些基因通过细菌而影响我们。英国的研究显示，转基因作物中的突变基因可能会进入到生物体内，其结果可能会导致新的疾病。如果类似结果发生在人和动物体内，就可能培养出功效最强的、抗菌素也无法杀死的超级细菌。
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