六朝古都，十朝都会，古称金陵的南京有着7000多年文明史和2600多年建城史，是著名历史文化名城，从秦淮河旁的夫子庙，到绿荫遮盖的中山陵，中华民族的历史在这座城市留下了浓墨重彩的痕迹。
今天的南京，古老而又充满活力，历史文化名城和现代都市重合交融一起，山水城林，交相辉映。但和所有经历过日寇侵华战争的城市一样，南京也有一段草木见悲的历史。
1937年12月，日军攻陷南京，在南京城区及郊区对中国平民进行大肆屠杀，南京城血流 成河，30万同胞成为刀下亡魂。“江边流水尽为之赤，城内外所有河渠、沟壑无不填满尸体。” 就在制造了这一震惊世界的暴行一年多后，日本军国主义者又给这个被眼泪和鲜血浸透了城 市带去了可怖的伤害——日本细菌战部队的幽灵开始在南京城闪现。
隐藏于闹市的细菌战魔窟
在日本野战部队系统中，每一个方面军均设有防疫给水部本部，每一个师团均设有防疫给水部。师团防疫给水部的任务主要有四项：一是防疫，二是给水，三是地区卫生状态调查，四是机器修理。方面军防疫给水部本部除上述任务外，还承担防疫与给水相关问题的调查与研究、为部队提供标准痘苗血清、防疫与给水的训练等。
但日本在发动侵华战争后，试图在必要时通过发动细菌战，以适应长期作战，弥补兵力不足的缺陷。研制细菌和承担实施细菌作战的任务，成为日军防疫给水部队特别是方面军防疫给水部本部的主要功能。挂在这些部队门口的某某防疫给水部招牌，只是为了掩人耳目。
1936年8月，“关东军防疫给水部”（1941 年改称731部队）在哈尔滨东南郊平房镇建立，石井四郎任部队长。该部队专门从事细菌武器 生产和细菌研究，机构设立后就对中国人开始 了惨无人道的实验和残害。
和臭名昭著的731部队一样，设在南京的 “华中派遣军防疫给水部”是日军实施细菌战的又一魔窟。1939年4月18日，日军在南京设立“荣”字 第1644部队，对外名称为“华中派遣军防疫给水部”。
部队本部位于南京市中心的原南京中央陆军医院，西边是扬子江，北边正对着紫金 山。距基地北边不远，是通向山上孙中山陵墓的路。
日军的军用机场在路对面，为来往于1644部队总部的军事和医务人员提供便利的交通条件，酒馆、艺妓馆及日本的中国派遣军总司令部、宪兵司令部、日本领事馆、陆军医院、 一家日本人电影院和一家日本人开的百货大楼，都在步行30分钟的范围内，部队的各种需 求都可以就近得到满足。
细菌部队营区环绕着3米高的砖墙，墙头上架设着铁丝网和几股通电的铁丝。一支精锐警察部队每天24小时在营区内外巡逻警卫，还配备了警犬对付“逃犯”和“非法侵入者”。
为了保证基地人员不泄露细菌战机密，每一个来基地工作的人，都要签誓约书，保证不对外透露看到、听到的一切。士兵在营区内不能拍照片，在给亲人写信时不能提到1644部队，所有邮件都要接受上级检查。
临着营区南门的6层楼房是基地主楼，大楼里有司令官办公室和各个行政管理办公室。主楼后面的一幢4层楼房为副楼，绝大部分细菌战研究和人体实验都在这里进行：一层包括细菌培育室、消毒室、检水室；二层饲养小型实验动物，如虱子、跳蚤、小鼠、大鼠、地松鼠等；三层是“犯人”活体实验室；四层是监禁实验“犯人”的地方。
营区里还有食堂、仓库、细菌战实战人员训练用营房、健身房、游泳池、礼堂、兵器库、衣类消毒所、图书馆等各种设施。还有一座专门用来处理实验动物和人的遗体的焚尸炉。工作人员防护措施非常到位，工作时戴着橡胶手套和一些口鼻面罩，离开建筑物前要用消毒皂液等进行消毒。同时，工作人员每3个月需要服用含有某些免疫制剂的药丸。
除本部外，1644部队还在上海、苏州、杭州、九江、南昌、安庆、汉口等地设立了12个支队。
和731部队关系紧密
1644部队首任部队长由731部队的部队长石井四郎兼任，因此1644部队也被称为“石井 （四）部队”。石井兼任部队长期间，曾派其心腹增田知贞在南京代理部长一职。
同石井一样，增田也是细菌战的狂热鼓吹者，1941年2月他正式就任1644部队部队长一职；1942年，太田澄为第三任部队长；1943年，佐藤俊二为第四任部队长；1944年，近野寿男接替佐藤；最后一任部队长是山崎新，他的任期不到4个月，日本便宣布投降。
1644部队部队长都来自731部队，其与731部队保持着极为密切的联系。1644部队刚成立时，绝大部分军佐、士兵 及技研人员都来自731部队，主要设备器材也多从731部队调集。因此1644部队研制细菌武器的模式几乎完全模仿平房。
同731部队相比，1644部队的规模并不大，但由于得到731部队的大力支持和石井四郎的高度重视，很快拥有了相当强的细菌生产能力。
其主要细菌培养室拥有两个大自闭桶、大约200个“石井式”培养器和50个“科哈式”锅炉，还有10个锅炉分散在几个支部。如果全部开动，1644部队一个生产周期能生产10公斤细菌。
他们还大量繁殖跳蚤，为了繁殖跳蚤，用了约100只汽油桶。随着一个个生产周期的运行，一群又一群跳蚤从这些汽油桶里蜂拥而出，被用于鼠疫实验。
九华山下的“死亡工厂”
侵华日军研究致命病菌的目的，是要实施对中国军民的细菌战，其研究成果必然要转化为批量生产，制成大量的细菌试剂，投入战场。日军在南京的“死亡工厂”就位于九华山下，为了伪装，对外称“血清疫苗制造厂”，日寇内部称其为“科学部队”，官兵多是细菌学专家和大学生。
为了隐蔽起见，无任何特别标志，平时极为机密。据当地居民说：“日本人在时，里面都是木板盖的白铁围的小房子，从来不准一个中国人进去。谁也不知里面做什么，只当是制药的。”1945年日军投降时即加以破坏。
1945年11月，南京大学生物学系助教朱洪文协助国民党政府接收该机构，发现了此处的真相。他在日记中记载：
“在接收时，那里还有 一座像一间房子一样大的高压消毒器残体，其旁装置一座大锅炉，用以供给蒸气，里面有铁 轨，一切培养细菌的材料先用车子载进去消毒，可见其制造规模的庞大。”
当时还接收了不少残余的东西，2000多只小白鼠和几百只天竺，培养细菌用的试管、平板各数十万只，细菌培养原料洋菜（琼脂）30余吨、鱼肉精膏百余箱。如果按2—3克琼脂可制造细菌悬液20—30毫升算，则日寇所余的这一批培养基就足以制造3万万毫升细菌武器。
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